Но в ваших базах данных уже могли появиться её последствия.
Что нужно сделать для исправления ситуации: нужно открыть "физическое лицо" (не студента, а физическое лицо!), которое дублируется в отчете и перезаписать элемент. Удобно это сделать прямо из отчета "Списки учебных групп": формируем отчет без отбора по группе, находим дублирующийся элемент, щелкаем на ФИО, выбираем "Открыть Студент = ..." - открывается элемент справочника "Студенты", нажимаем на лупу поля "Данные о физическом лице" и в открывшейся форме сразу нажимаем "Записать и закрыть", затем закрываем форму элемента справочника "Студенты" и возвращаемся в отчет, ищем следующий дубль...
Пока есть предположение, что таких ситуаций у вас не должно быть много и исправить ситуацию вручную достаточно просто. Если мы ошибаемся и у кого-то в базе данных очень много таких студентов, пишите нам, попробуем написать обработку для автоматического исправления этой ошибки.